ASP.NETのサーバーへファイルをアップロードするサンプルです。。
submitでファイルをASP.NETのサーバー転送しています。またそのときにsubmitによるページ遷移をさせないようにしています。
jQuery.uploadを利用していません。jQuery.uploadでは「http://localhost/」を付加したURLでは正常に動作しませんが、このサンプルでは動作します。
「http://localhost/」が使えるということは、ポートの異なるApache開発環境とAsp.net開発環境の間でデータをやりとりできることになります。
サンプル
ホスト名
ASP.NETファイルアップロードaspx

JavaScript

			
		//submitボタンが押されたときのイベント。
		$(function(){
			  $("#form1").submit(function(){

				  //ファイルアップローURLを組み立て。
				  var host=$("#host_id").val();
				  var aspx=$("#aspx_id").val();
				  var url=host+aspx;

				  //ファイルアップロードエレメントを取得。
			    var form = $(this);
			    var fd = new FormData(form[0]);

			    //☆非同期通信によるファイルアップロード。
			    $.ajax(url, {
			      type: 'post',
			      processData: false,
			      contentType: false,
			      data: fd,
			      dataType: 'html',
			      success: function(data){
				      //ファイルアップロード成功時の処理。
				      var imgUrl=host+"uploads/"+data;//ファイル名を作成。
				      $("#img1").attr("src",imgUrl);//imgタグのsrc属性にファイル名をセット。
			        console.log(data);//ログ出力。
			      }
			    });
			    return false;//submitで画面遷移させない。
			  });
			});
			
			

html

			
			<table style="width:100%"><tbody style="background-color:#ff816f">
				<tr><td style="width:20%">ホスト名</td><td>:</td><td style="widht:70%"><input type="text" id="host_id" value="http://localhost:2368/" /></td></tr>
				<tr><td>ASP.NETファイルアップロードaspx</td><td>:</td><td><input type="text" id="aspx_id" value="FileUploader.aspx" /></td></tr>
			</tbody></table>
			<form id="form1" method="post" action="" enctype="multipart/form-data">
			  <div><input id="upload_file" type="file" name="upload_file"></div>
			  <input id="submit1" type="submit" value="アップロード">
			</form>
			<img id="img1" src="" />
			

FileUploader.aspx

			
			protected void Page_Load(object sender, EventArgs e)
			{
			    Response.AppendHeader("Access-Control-Allow-Origin", "*");//クロスドメイン通信を許可する。
			
			    HttpPostedFile f = Request.Files["upload_file"];//アップロードファイルオブジェクトを取得。
			    string path = Server.MapPath("/")+"uploads/";//パスを取得。
			
			    if (f != null)
			    {
			        Debug.WriteLine(f.FileName);//デバッグ
			        string fileUrl = path + f.FileName;//パス付ファイル名を組み立て。
			        f.SaveAs(fileUrl);//保存する。
			        Response.Write(f.FileName);//ajaxのレスポンス用のファイル名を書き出す。ここで書き出した文字はajaxのコールバック関数の引数になる。
			    }
			}