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ID種類科和名学名1991年版1997-1999年版2006-2007年版2012年版固有種備考
1両生類サンショウウオアベサンショウウオHynobius abei絶滅危惧種絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
2両生類サンショウウオアカイシサンショウウオHynobius katoi--絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
3両生類サンショウウオハクバサンショウウオHynobius hidamontanus危急種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
4両生類サンショウウオホクリクサンショウウオHynobius takedai絶滅危惧種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
5両生類サンショウウオオオイタサンショウウオHynobius dunni希少種絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類1997年版から、「高知県のオオイタサンショウウオ個体群」も含む。
6両生類サンショウウオオオダイガハラサンショウウオHynobius boulengeri地域個体群地域個体群絶滅危惧II類絶滅危惧II類1997年版まで、「本州・九州地域のオオダイガハラサンショウウオ個体群」を評価単位としていた。
7両生類サンショウウオオキサンショウウオHynobius okiensis希少種絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
8両生類サンショウウオカスミサンショウウオHynobius nebulosus地域個体群地域個体群絶滅危惧II類絶滅危惧II類1997年版まで、「京都・大阪地域のカスミサンショウウオ個体群」を評価単位としていた。さらに、「愛知県のトウキョウサンショウウオ個体群」も分類の変更により含まれる。
9両生類サンショウウオトウキョウサンショウウオHynobius tokyoensis地域個体群地域個体群絶滅危惧II類絶滅危惧II類1997年版まで、「東京都のトウキョウサンショウウオ個体群」を評価単位としていた。
10両生類サンショウウオベッコウサンショウウオHynobius stejnegeri希少種準絶滅危惧絶滅危惧II類絶滅危惧II類
11両生類サンショウウオキタサンショウウオSalamandrella keyserlingii希少種準絶滅危惧準絶滅危惧準絶滅危惧
12両生類サンショウウオイシヅチサンショウウオHynobius hirosei---準絶滅危惧オオダイガハラサンショウウオ四国個体群とされていたものが独立種となった。
13両生類サンショウウオクロサンショウウオHynobius nigrescens--準絶滅危惧準絶滅危惧
14両生類サンショウウオコガタブチサンショウウオHynobius yatsui---準絶滅危惧ブチサンショウウオの山地小型個体群とされていたものが独立種となった
15両生類サンショウウオツシマサンショウウオHynobius tsuensis--準絶滅危惧準絶滅危惧
16両生類サンショウウオトウホクサンショウウオHynobius lichenatus--準絶滅危惧準絶滅危惧
17両生類サンショウウオヒダサンショウウオHynobius kimurae--準絶滅危惧準絶滅危惧
18両生類サンショウウオブチサンショウウオHynobius naevius--準絶滅危惧準絶滅危惧
19両生類サンショウウオエゾサンショウウオHynobius retardatus--情報不足情報不足
20両生類オオサンショウウオオオサンショウウオAndrias japonicus希少種準絶滅危惧絶滅危惧II類絶滅危惧II類
21両生類イモリイボイモリEchinotriton andersoni希少種絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
22両生類イモリアカハライモリCynops pyrrhogaster--準絶滅危惧準絶滅危惧
23両生類イモリシリケンイモリCynops ensicauda-準絶滅危惧準絶滅危惧準絶滅危惧
24両生類ヒキガエルミヤコヒキガエルBufo gargarizans miyakonis--準絶滅危惧準絶滅危惧
25両生類アカガエルアマミイシカワガエルOdorrana splendida---絶滅危惧IB類イシカワガエルの奄美大島個体群とされていたものが独立種となった。
26両生類アカガエルオキナワイシカワガエルOdorrana ishikawae危急種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類2006年版まで、和名をイシカワガエルとしていた。アマミイシカワガエル備考欄の理由により沖縄島個体群のみがO. ishikawaeとなり、それに伴い和名が変更された。
27両生類アカガエルコガタハナサキガエルOdorrana utsunomiyaorum-絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
28両生類アカガエルオットンガエルBabina subaspera危急種絶滅危惧II類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
29両生類アカガエルナゴヤダルマガエルRana porosa brevipoda希少種絶滅危惧II類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類1997年版まで、和名をダルマガエルとしていた。
30両生類アカガエルナミエガエルLimnonectes namiyei希少種絶滅危惧II類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
31両生類アカガエルホルストガエルBabina holsti危急種絶滅危惧II類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
32両生類アカガエルアマミハナサキガエルOdorrana amamiensis-絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
33両生類アカガエルハナサキガエルOdorrana narina-絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
34両生類アカガエルヤエヤマハラブチガエルRana okinavana--絶滅危惧II類絶滅危惧II類2006年版まで学名がRana psaltesだったが、リュウキュウアカガエルの学名とされていたR. okinavanaの模式標本がヤエヤマハラブチガエルであったことが判明したため学名が変更された。
35両生類アカガエルアマミアカガエルRana kobai---準絶滅危惧リュウキュウアカガエルの奄美諸島個体群とされていたものが独立種となった
36両生類アカガエルオキタゴガエルRana tagoi okiensis---準絶滅危惧
37両生類アカガエルヤクシマタゴガエルRana tagoi yakushimensis---準絶滅危惧
38両生類アカガエルトウキョウダルマガエルRana porosa porosa--準絶滅危惧準絶滅危惧
39両生類アカガエルチョウセンヤマアカガエルRana dybowskii--準絶滅危惧準絶滅危惧
40両生類アカガエルツシマアカガエルRana tsushimensis--準絶滅危惧準絶滅危惧
41両生類アカガエルトノサマガエルRana nigromaculata---準絶滅危惧
42両生類アカガエルリュウキュウアカガエルRana ulma--準絶滅危惧準絶滅危惧2006年版まで学名がRana okinavanaだったが、R. okinavanaの模式標本がヤエヤマハラブチガエルであったことが判明したため改めて新種として記載された。
43爬虫類ウミガメアカウミガメCaretta caretta希少種絶滅危惧II類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
44爬虫類ウミガメタイマイEretmochelys imbricata希少種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
45爬虫類ウミガメアオウミガメChelonia mydas mydas希少種絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
46爬虫類イシガメヤエヤマセマルハコガメCuora flavomarginata evelynae危急種絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類1997年版まで、和名をセマルハコガメとしていた。
47爬虫類イシガメリュウキュウヤマガメGeoemyda japonica危急種絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
48爬虫類イシガメニホンイシガメMauremys japonica--情報不足準絶滅危惧
49爬虫類スッポンニホンスッポンPelodiscus sinensis-情報不足情報不足情報不足1997年版までスッポンを、2006年版ではP. s. japonicusとして評価していた。
50爬虫類トカゲモドキイヘヤトカゲモドキGoniurosaurus kuroiwae toyamai希少種絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類1991年版では、種クロイワトカゲモドキとして評価していた。
51爬虫類トカゲモドキクメトカゲモドキGoniurosaurus kuroiwae yamashinae希少種絶滅危惧IB類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類1991年版では、種クロイワトカゲモドキとして評価していた。
52爬虫類トカゲモドキオビトカゲモドキGoniurosaurus kuroiwae splendens希少種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類1991年版では、種クロイワトカゲモドキとして評価していた。
53爬虫類トカゲモドキマダラトカゲモドキGGoniurosaurus kuroiwae orientalis希少種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類1991年版では、種クロイワトカゲモドキとして評価していた。
54爬虫類トカゲモドキクロイワトカゲモドキGoniurosaurus kuroiwae kuroiwae希少種絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
55爬虫類ヤモリミナミトリシマヤモリPerochirus ateles---絶滅危惧II類
56爬虫類ヤモリタシロヤモリHemidactylus bowringii--情報不足絶滅危惧II類
57爬虫類ヤモリヤクヤモリGekko yakuensis---絶滅危惧II類
58爬虫類ヤモリオキナワヤモリGekko sp. 1--準絶滅危惧準絶滅危惧
59爬虫類ヤモリタカラヤモリGekko shibatai--準絶滅危惧準絶滅危惧
60爬虫類ヤモリタワヤモリGekko tawaensis---準絶滅危惧
61爬虫類ヤモリ大東諸島のオガサワラヤモリLepidodactylus lugubrisi--地域個体群地域個体群
62爬虫類アガマオキナワキノボリトカゲJapalura polygonata polygonata-絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類1997年版まで、和名をキノボリトカゲとしていた。
63爬虫類アガマヨナグニキノボリトカゲJapalura polygonata donan--絶滅危惧II類絶滅危惧II類
64爬虫類アガマサキシマキノボリトカゲJapalura polygonata ishigakiensis--準絶滅危惧準絶滅危惧
65爬虫類カナヘビミヤコカナヘビTakydromus toyamai--絶滅危惧IB類絶滅危惧IA類
66爬虫類カナヘビサキシマカナヘビTakydromus dorsalis--絶滅危惧II類絶滅危惧II類
67爬虫類カナヘビコモチカナヘビZootoca vivipara--絶滅危惧II類絶滅危惧II類
68爬虫類カナヘビアムールカナヘビTakydromus amurensis--準絶滅危惧準絶滅危惧
69爬虫類カナヘビ沖永良部島、徳之島のアオカナヘビTakydromus smaragdinusi--地域個体群地域個体群
70爬虫類ナミヘビキクザトサワヘビOpisthotropis kikuzatoi絶滅危惧種絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
71爬虫類ナミヘビシュウダElaphe carinata carinata--絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
72爬虫類ナミヘビヨナグニシュウダElaphe carinata yonaguniensis-絶滅危惧II類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
73爬虫類ナミヘビミヤコヒバァAmphiesma concelarum-絶滅危惧II類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
74爬虫類ナミヘビミヤコヒメヘビCalamaria pfefferi希少種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類1997年版まで、和名をヒメヘビとしていた。
75爬虫類ナミヘビヤエヤマタカチホヘビAchalinus formosanus chigiraii希少種準絶滅危惧準絶滅危惧絶滅危惧II類
76爬虫類ナミヘビサキシマスジオElaphe taeniura schmackeri--絶滅危惧II類絶滅危惧II類
77爬虫類ナミヘビミヤラヒメヘビCalamaria pavimentata miyarai-絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
78爬虫類ナミヘビサキシマアオヘビCyclophiops herminaei希少種準絶滅危惧準絶滅危惧準絶滅危惧
79爬虫類ナミヘビサキシマバイカダLycodon ruhstrati multifasciatusi-準絶滅危惧準絶滅危惧準絶滅危惧
80爬虫類ナミヘビイワサキセダカヘビPareas iwasakiii希少種準絶滅危惧準絶滅危惧準絶滅危惧
81爬虫類ナミヘビアマミタカチホヘビAchalinus wernerii希少種準絶滅危惧準絶滅危惧準絶滅危惧
82爬虫類ナミヘビアカマダラDinodon rufozonatum rufozonatumi--準絶滅危惧準絶滅危惧
83爬虫類ナミヘビダンジョヒバカリAmphiesma vibakari danjoense--情報不足情報不足
84爬虫類ナミヘビ宮古諸島のサキシママダラDinodon rufozonatum walli---地域個体群
85爬虫類コブラクメジマハイSinomicrurus japonicus takarai--絶滅危惧II類絶滅危惧II類
86爬虫類コブライワサキワモンベニヘビHemibungarus macclellandi iwasakii希少種準絶滅危惧絶滅危惧II類絶滅危惧II類
87爬虫類コブラハイSinomicrurus japonicus boettgeri-準絶滅危惧準絶滅危惧準絶滅危惧
88爬虫類コブラヒャンSinomicrurus japonicus japonicus希少種準絶滅危惧準絶滅危惧準絶滅危惧
89爬虫類ウミヘビエラブウミヘビLaticauda semifasciata--絶滅危惧II類絶滅危惧II類
90爬虫類ウミヘビヒロオウミヘビLaticauda laticaudata--絶滅危惧II類絶滅危惧II類
91爬虫類ウミヘビイイジマウミヘビEmydocephalus ijimae--絶滅危惧II類絶滅危惧II類
92爬虫類クサリヘビトカラハブProtobothrops tokarensis--準絶滅危惧準絶滅危惧
92鳥類カイツブリ青森県のカンムリカイツブリ繁殖個体群Podiceps cristatus cristatus危急種地域個体群地域個体群地域個体群
93鳥類アホウドリコアホウドリDiomedea immutabilis希少種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
94鳥類アホウドリアホウドリDiomedea albatrus絶滅危惧種絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
95鳥類ミズナギドリオガサワラヒメミズナギドリPuffinus bryani---絶滅危惧IA類
96鳥類ミズナギドリセグロミズナギドリPuffinus lherminieri bannermani希少種情報不足情報不足絶滅危惧IB類○
97鳥類ミズナギドリシロハラミズナギドリPterodroma hypoleuca-情報不足情報不足情報不足
98鳥類ウミツバメクロコシジロウミツバメOceanodroma castro希少種絶滅危惧II類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
99鳥類ウミツバメヒメクロウミツバメOceanodroma monorhis希少種絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
100鳥類ウミツバメオーストンウミツバメOceanodroma tristrami-絶滅危惧II類絶滅危惧II類準絶滅危惧
101鳥類ウミツバメクロウミツバメOceanodroma matsudairae危急種絶滅危惧II類絶滅危惧IB類準絶滅危惧
102鳥類ネッタイチョウアカオネッタイチョウPhaethon rubricauda rothschildi-絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類○
103鳥類カツオドリアカアシカツオドリSula sula rubripes希少種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類○
104鳥類カツオドリアオツラカツオドリSula dactylatra personata希少種絶滅危惧II類絶滅危惧II類-
105鳥類ウチシマウガラスPhalacrocorax urile絶滅危惧種絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
106鳥類ウヒメウPhalacrocorax pelagicus pelagicus--絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
107鳥類サギハシブトゴイNycticorax caledonicus crassirostris絶滅種絶滅絶滅絶滅
108鳥類サギオオヨシゴイIxobrychus eurhythmus希少種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IA類
109鳥類サギサンカノゴイBotaurus stellaris stellaris希少種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類○
110鳥類サギミゾゴイGorsachius goisagi希少種準絶滅危惧絶滅危惧IB類絶滅危惧II類
111鳥類サギズグロミゾゴイGorsachius melanolophus希少種準絶滅危惧絶滅危惧II類絶滅危惧II類
112鳥類サギヨシゴイIxobrychus sinensis sinensis--準絶滅危惧準絶滅危惧
113鳥類サギチュウサギEgretta intermedia intermedia希少種準絶滅危惧準絶滅危惧準絶滅危惧
114鳥類サギカラシラサギEgretta eulophotes希少種情報不足準絶滅危惧準絶滅危惧
115鳥類コウノトリコウノトリCiconia boyciana絶滅危惧種絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
116鳥類コウノトリナベコウCiconia nigra希少種---
117鳥類トキトキNipponia nippon絶滅危惧種野生絶滅野生絶滅野生絶滅
118鳥類トキクロツラヘラサギPlatalea minor希少種絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IB類
119鳥類トキヘラサギPlatalea leucorodia major希少種情報不足情報不足情報不足
120鳥類トキクロトキThreskiornis melanocephalus希少種情報不足情報不足情報不足
121鳥類カモカンムリツクシガモTadorna cristata絶滅種絶滅絶滅絶滅
122鳥類カモシジュウカラガンBranta canadensis leucopareia危急種絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
123鳥類カモハクガンAnser caerulescens caerulescens-情報不足情報不足絶滅危惧IA類
124鳥類カモカリガネAnser erythropus--準絶滅危惧絶滅危惧IB類
125鳥類カモコクガンBranta bernicla orientalis希少種絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
126鳥類カモヒシクイAnser fabalis serrirostris希少種絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
127鳥類カモツクシガモTadorna tadorna危急種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧II類
128鳥類カモトモエガモAnas formosa希少種絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
129鳥類カモマガンAnser albifrons frontalis希少種準絶滅危惧準絶滅危惧準絶滅危惧
130鳥類カモオオヒシクイAnser fabalis middendorffii-準絶滅危惧準絶滅危惧準絶滅危惧
131鳥類カモサカツラガンAnser cygnoides危急種情報不足情報不足情報不足
132鳥類カモアカツクシガモTadorna ferruginea希少種情報不足情報不足情報不足
133鳥類カモオシドリAix galericulata--情報不足情報不足
134鳥類カモアカハジロAythya baeri希少種情報不足情報不足情報不足
135鳥類カモ東北地方以北のシノリガモ繁殖個体群Histrionicus histrionicus pacificus希少種地域個体群地域個体群地域個体群
136鳥類カモコハクチョウCygnus columbianus jankowskii希少種---
137鳥類カモコウライアイサMergus squamatus希少種情報不足情報不足-
138鳥類タカダイトウノスリButeo buteo oshiroi絶滅危惧種絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅○
139鳥類タカカンムリワシSpilornis cheela perplexus絶滅危惧種絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類○
140鳥類タカオジロワシHaliaeetus albicilla albicilla絶滅危惧種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧II類
141鳥類タカリュウキュウツミAccipiter gularis iwasakii希少種絶滅危惧II類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類○
142鳥類タカオガサワラノスリButeo buteo toyoshimai絶滅危惧種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類○
143鳥類タカクマタカSpizaetus nipalensis orientalis絶滅危惧種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
144鳥類タカイヌワシAquila chrysaetos japonica絶滅危惧種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
145鳥類タカチュウヒCircus spilonotus spilonotus危急種絶滅危惧II類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
146鳥類タカオオワシHaliaeetus pelagicus pelagicus危急種絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
147鳥類タカサシバButastur indicus--絶滅危惧II類絶滅危惧II類
148鳥類タカミサゴPandion haliaetus haliaetus危急種準絶滅危惧準絶滅危惧準絶滅危惧
149鳥類タカハチクマPernis apivorus orientalis希少種準絶滅危惧準絶滅危惧準絶滅危惧
150鳥類タカオオタカAccipiter gentilis fujiyamae危急種絶滅危惧II類準絶滅危惧準絶滅危惧
151鳥類タカハイタカAccipiter nisus nisosimilis希少種準絶滅危惧準絶滅危惧準絶滅危惧
152鳥類ハヤブサハヤブサFalco peregrinus japonensis危急種絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類○
153鳥類ハヤブサシマハヤブサFalco peregrinus furuitii危急種絶滅危惧IB類絶滅危惧IA類情報不足○
154鳥類ハヤブサオオハヤブサFalco peregrinus pealei希少種情報不足--
155鳥類ハヤブサシベリアハヤブサFalco peregrinus harterti希少種---
156鳥類ライチョウライチョウLagopus mutus japonicus絶滅危惧種絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧IB類○
157鳥類ライチョウエゾライチョウTetrastes bonasia vicinitas-情報不足情報不足情報不足
158鳥類キジウズラCoturnix japonica-情報不足準絶滅危惧絶滅危惧II類
159鳥類キジアカヤマドリSyrmaticus soemmerringii soemmerringii--準絶滅危惧準絶滅危惧○
160鳥類キジコシジロヤマドリSyrmaticus soemmerringii ijimae希少種準絶滅危惧準絶滅危惧準絶滅危惧○
161鳥類ツルタンチョウGrus japonensis絶滅危惧種絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
162鳥類ツルナベヅルGrus monacha危急種絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
163鳥類ツルマナヅルGrus vipio危急種絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
164鳥類ツルクロヅルGrus grus lilfordi希少種情報不足情報不足情報不足
165鳥類ツルカナダヅルGrus canadensis canadensis希少種---
166鳥類ツルソデグロヅルGrus leucogeranus希少種---
167鳥類ツルアネハヅルAnthropoides virgo希少種---
168鳥類クイナマミジロクイナPoliolimnas cinereus brevipes絶滅種絶滅絶滅絶滅○
169鳥類クイナヤンバルクイナGallirallus okinawae絶滅危惧種絶滅危惧IB類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類○
170鳥類クイナオオクイナRallina eurizonoides sepiaria危急種絶滅危惧II類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類○
171鳥類クイナシマクイナCoturnicops noveboracensis exquisitus希少種絶滅危惧II類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
172鳥類クイナヒクイナPorzana fusca erythrothorax--絶滅危惧II類準絶滅危惧
173鳥類ノガンノガンOtis tarda dybowskii希少種---
174鳥類タマシギタマシギRostratula benghalensis benghalensis---絶滅危惧II類
175鳥類チドリシロチドリCharadrius alexandrinus---絶滅危惧II類
176鳥類シギヘラシギEurynorhynchus pygmeus危急種絶滅危惧IB類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
177鳥類シギカラフトアオアシシギTringa guttifer危急種絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
178鳥類シギコシャクシギNumenius minutus危急種絶滅危惧IA類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
179鳥類シギツルシギTringa erythropus---絶滅危惧II類
180鳥類シギアカアシシギTringa totanus ussuriensis希少種絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
181鳥類シギタカブシギTringa glareola---絶滅危惧II類
182鳥類シギオオソリハシシギLimosa lapponica---絶滅危惧II類
183鳥類シギホウロクシギNumenius madagascariensis希少種絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
184鳥類シギアマミヤマシギScolopax mira絶滅危惧種絶滅危惧IB類絶滅危惧II類絶滅危惧II類○
185鳥類シギハマシギCalidris alpina---準絶滅危惧
186鳥類シギオオジシギGallinago hardwickii希少種準絶滅危惧準絶滅危惧準絶滅危惧
187鳥類シギケリVanellus cinereus---情報不足
188鳥類シギチシマシギCalidris ptilocnemis kurilensis希少種絶滅危惧IB類情報不足情報不足
189鳥類シギシベリアオオハシシギLimnodromus semipalmatus危急種情報不足情報不足情報不足
190鳥類シギシロハラチュウシャクシギNumenius tenuirostris希少種---
191鳥類セイタカシギセイタカシギHimantopus himantopus himantopus希少種絶滅危惧IB類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
192鳥類セイタカシギツバメチドリ科
193鳥類セイタカシギツバメチドリGlareola maldivarum希少種絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
194鳥類カモメズグロカモメLarus saundersi-絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
195鳥類カモメオオアジサシThalasseus bergii cristatus希少種絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
196鳥類カモメベニアジサシSterna dougallii bangsi希少種準絶滅危惧絶滅危惧II類絶滅危惧II類
197鳥類カモメエリグロアジサシSterna sumatrana希少種準絶滅危惧準絶滅危惧絶滅危惧II類
198鳥類カモメコアジサシSterna albifrons sinensis希少種絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
199鳥類ウミスズメウミガラスUria aalge inornata絶滅危惧種絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
200鳥類ウミスズメウミスズメSynthliboramphus antiquus希少種絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
201鳥類ウミスズメエトピリカLunda cirrhata絶滅危惧種絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
202鳥類ウミスズメケイマフリCepphus carbo-絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
203鳥類ウミスズメカンムリウミスズメSynthliboramphus wumizusume危急種絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
204鳥類ウミスズメマダラウミスズメBrachyramphus marmoratus perdix希少種情報不足情報不足情報不足
205鳥類ハトリュウキュウカラスバトColumba jouyi絶滅種絶滅絶滅絶滅○
206鳥類ハトオガサワラカラスバトColumba versicolor絶滅種絶滅絶滅絶滅○
207鳥類ハトアカガシラカラスバトColumba janthina nitens絶滅危惧種絶滅危惧IB類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類○
208鳥類ハトヨナクニカラスバトColumba janthina stejnegeri絶滅危惧種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類○
209鳥類ハトシラコバトStreptopelia decaocto decaocto希少種絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧IB類
210鳥類ハトキンバトChalcophaps indica yamashinai絶滅危惧種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類○
211鳥類ハトカラスバトColumba janthina janthina危急種準絶滅危惧準絶滅危惧準絶滅危惧
212鳥類フクロウワシミミズクBubo bubo-絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
213鳥類ヨタカヨタカCaprimulgus indicus jotaka--絶滅危惧II類準絶滅危惧
214鳥類カワセミミヤコショウビンHalcyon miyakoensis絶滅種絶滅絶滅絶滅○
215鳥類ブッポウソウブッポウソウEurystomus orientalis calonyx希少種絶滅危惧II類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
216鳥類キツツキキタタキDryocopus javensis richardsi絶滅種絶滅絶滅絶滅
217鳥類キツツキノグチゲラSapheopipo noguchii絶滅危惧種絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類○
218鳥類キツツキミユビゲラPicoides tridactylus inouyei絶滅危惧種絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類○
219鳥類キツツキクマゲラDryocopus martius martius危急種絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
220鳥類キツツキオーストンオオアカゲラDendrocopos leucotos owstoni絶滅危惧種絶滅危惧IB類絶滅危惧II類絶滅危惧II類○
221鳥類キツツキアマミコゲラDendrocopos kizuki amamii-絶滅危惧II類-○
222鳥類ヤイロチョウヤイロチョウPitta brachyura nympha絶滅危惧種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
223鳥類ヤイロチョウサンショウクイ科
224鳥類ヤイロチョウサンショウクイPericrocotus divaricatus divaricatus-絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
225鳥類ヒヨドリシロガシラ（ヤエヤマシロガシラ）Pycnonotus sinensis orii希少種---
226鳥類モズチゴモズLanius tigrinus-絶滅危惧II類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
227鳥類モズアカモズLanius cristatus superciliosus-準絶滅危惧絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
228鳥類ミソサザイダイトウミソサザイTroglodytes troglodytes orii絶滅種絶滅絶滅絶滅○
229鳥類ミソサザイモスケミソサザイTroglodytes troglodytes mosukei希少種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類○
230鳥類ツグミオガサワラガビチョウCichlopasser terrestris絶滅種絶滅絶滅絶滅○
231鳥類ツグミホントウアカヒゲErithacus komadori namiyei危急種絶滅危惧II類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類○
232鳥類ツグミアカコッコTurdus celaenops危急種絶滅危惧II類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類○
233鳥類ツグミタネコマドリErithacus akahige tanensis希少種絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類○
234鳥類ツグミアカヒゲErithacus komadori komadori危急種絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類○
235鳥類ツグミオオトラツグミZoothera dauma major絶滅危惧種絶滅危惧IA類絶滅危惧II類絶滅危惧II類○
236鳥類ツグミウスアカヒゲErithacus komadori subrufus危急種絶滅危惧IA類情報不足情報不足○
237鳥類ツグミコトラツグミZoothera dauma horsfieldi--情報不足情報不足
238鳥類ウグイスダイトウウグイスCettia diphone restricta絶滅種絶滅絶滅絶滅○[8]
239鳥類ウグイスオオセッカLocustella pryeri pryeri危急種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類○
240鳥類ウグイスウチヤマセンニュウLocustella pleskei希少種絶滅危惧II類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類[9]
241鳥類ウグイスイイジマムシクイPhylloscopus ijimae希少種絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類○
242鳥類ウグイスマキノセンニュウLocustella lanceolata---準絶滅危惧
243鳥類ウグイスウグイスの1亜種Cettia diphone ssp.---情報不足
244鳥類シジュウカラダイトウヤマガラParus varius orii絶滅種絶滅絶滅絶滅○
245鳥類シジュウカラナミエヤマガラParus varius namiyei希少種絶滅危惧II類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類○
246鳥類シジュウカラオーストンヤマガラParus varius owstoni希少種絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧IB類○
247鳥類シジュウカラオリイヤマガラParus varius olivaceus希少種絶滅危惧II類準絶滅危惧準絶滅危惧○
248鳥類ミツスイムコジマメグロApalopteron familiare familiare絶滅種絶滅絶滅絶滅○
249鳥類ミツスイハハジマメグロApalopteron familiare hahasima絶滅危惧種絶滅危惧II類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類○
250鳥類ホオジロシマアオジEmberiza aureola ornata-準絶滅危惧絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
251鳥類ホオジロコジュリンEmberiza yessoensis yessoensis希少種絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
252鳥類ホオジロノジコEmberiza sulphurata-準絶滅危惧準絶滅危惧準絶滅危惧○
253鳥類アトリオガサワラマシコChaunoproctus ferreorostris絶滅種絶滅絶滅絶滅○
254鳥類アトリオガサワラカワラヒワCarduelis sinica kittlitzi絶滅危惧種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IA類○
255鳥類カラスルリカケスGarrulus lidthi危急種絶滅危惧II類--○
256鳥類カササギカササギPica pica sericea希少種---
257哺乳類トガリネズミオリイジネズミCrocidura orii-絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
258哺乳類トガリネズミトウキョウトガリネズミSorex minutissimus hawkeri危急種絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
259哺乳類トガリネズミアズミトガリネズミSorex hosonoi希少種準絶滅危惧準絶滅危惧準絶滅危惧2006年版までは亜種別に評価していた。
260哺乳類トガリネズミシコクトガリネズミSorex shinto shikokensis--情報不足準絶滅危惧
261哺乳類トガリネズミコジネズミCrocidura shantungensis危急種準絶滅危惧絶滅危惧II類準絶滅危惧1998年版まではチョウセンコジネズミで評価した。
262哺乳類トガリネズミワタセジネズミCrocidura watasei危急種準絶滅危惧準絶滅危惧準絶滅危惧
263哺乳類トガリネズミ九州地方のカワネズミChimarrogale platycephala--地域個体群地域個体群
264哺乳類トガリネズミサドトガリネズミSorex sadonisus-準絶滅危惧--
265哺乳類モグラセンカクモグラMogera uchidai-絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
266哺乳類モグラエチゴモグラMogera etigo希少種絶滅危惧II類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類1991年版では種サドモグラで評価した。
267哺乳類モグラミズラモグラEuroscaptor mizura-準絶滅危惧準絶滅危惧準絶滅危惧2006年版までは亜種別に評価していた。
268哺乳類モグラサドモグラMogera tokudae希少種準絶滅危惧準絶滅危惧準絶滅危惧
269哺乳類オオコウモリオキナワオオコウモリPteropus loochoensis絶滅種絶滅絶滅絶滅
270哺乳類オオコウモリダイトウオオコウモリPteropus dasymallus daitoensis希少種絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
271哺乳類オオコウモリエラブオオコウモリPteropus dasymallus dasymallus希少種絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
272哺乳類オオコウモリオガサワラオオコウモリPteropus pselaphon危急種絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IB類
273哺乳類オオコウモリオリイオオコウモリPteropus dasymallus inopinatus希少種---
274哺乳類オオコウモリキクガシラコウモリ科
275哺乳類オオコウモリミヤココキクガシラコウモリRhinolophus pumilus miyakonis希少種絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅
276哺乳類オオコウモリオリイコキクガシラコウモリRhinolophus cornutus orii-絶滅危惧II類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
277哺乳類オオコウモリオキナワコキクガシラコウモリRhinolophus pumilus pumilus-絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
278哺乳類オオコウモリヤエヤマコキクガシラコウモリRhinolophus perditus-絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧II類2006年版までは亜種別に評価していた。
279哺乳類カグラコウモリ与那国島のカグラコウモリHipposideros turpis希少種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類個体群2006年版までは種で評価していた。
280哺乳類カグラコウモリ波照間島のカグラコウモリHipposideros turpis希少種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類個体群2006年版までは種で評価していた。
281哺乳類ヒナコウモリオガサワラアブラコウモリPipistrellus sturdeei絶滅種絶滅絶滅絶滅
282哺乳類ヒナコウモリクロアカコウモリMyotis formosus希少種情報不足情報不足絶滅危惧IA類2006年版までは亜種ツシマクロアカコウモリとして評価していた。
283哺乳類ヒナコウモリヤンバルホオヒゲコウモリMyotis yanbarensis-絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
284哺乳類ヒナコウモリコヤマコウモリNyctalus furvus-絶滅危惧IB類絶滅危惧II類絶滅危惧IB類
285哺乳類ヒナコウモリリュウキュウユビナガコウモリMiniopterus fuscus-絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
286哺乳類ヒナコウモリリュウキュウテングコウモリMurina ryukyuana-絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
287哺乳類ヒナコウモリクビワコウモリEptesicus japonensis-絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧II類
288哺乳類ヒナコウモリヤマコウモリNyctalus aviator-絶滅危惧II類準絶滅危惧絶滅危惧II類
289哺乳類ヒナコウモリモリアブラコウモリPipistrellus endoi希少種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧II類
290哺乳類ヒナコウモリウスリホオヒゲコウモリMyotis gracilis-絶滅危惧II類絶滅危惧IB類絶滅危惧II類
291哺乳類ヒナコウモリホンドノレンコウモリMyotis nattereri bombinus-絶滅危惧IB類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
292哺乳類ヒナコウモリクロホオヒゲコウモリMyotis pruinosus希少種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧II類
293哺乳類ヒナコウモリオオアブラコウモリPipistrellus savii希少種情報不足情報不足情報不足2006年版までは亜種別に評価されていた
294哺乳類ヒナコウモリヒメヒナコウモリVespertilio murinus--情報不足情報不足
295哺乳類ヒナコウモリクチバテングコウモリMurina tenebrosa希少種情報不足情報不足情報不足
296哺乳類ヒナコウモリ本州のチチブコウモリBarbastella leucomelas darjelingensis希少種絶滅危惧II類地域個体群地域個体群1998年版ではチチブコウモリで評価した。
297哺乳類ヒナコウモリ四国のチチブコウモリBarbastella leucomelas darjelingensis希少種絶滅危惧II類地域個体群地域個体群1998年版ではチチブコウモリで評価した。
298哺乳類ヒナコウモリ近畿地方以西のウサギコウモリPlecotus sacrimontis-絶滅危惧II類-地域個体群
299哺乳類ヒナコウモリ紀伊半島のシナノホオヒゲコウモリMyotis ikonnikovi hosonoi希少種絶滅危惧IB類絶滅危惧II類地域個体群1991年版では種ヒメホオヒゲコウモリ、2006年版までは亜種シナノホオヒゲコウモリで評価されていた。
300哺乳類ヒナコウモリ中国地方のシナノホオヒゲコウモリMyotis ikonnikovi hosonoi希少種絶滅危惧IB類絶滅危惧II類地域個体群1991年版では種ヒメホオヒゲコウモリ、2006年版までは亜種シナノホオヒゲコウモリで評価されていた。
301哺乳類ヒナコウモリヒメホリカワコウモリEptesicus nilssonii parvus-絶滅危惧IB類--
302哺乳類ヒナコウモリニホンコテングコウモリMurina ussuriensis silvatica-絶滅危惧II類--
303哺乳類ヒナコウモリテングコウモリMurina hilgendorfi-絶滅危惧II類絶滅危惧II類-1998年版ではニホンテングコウモリで評価した。
304哺乳類ヒナコウモリウスリドーベントンコウモリMyotis daubentonii ussuriensis-絶滅危惧II類--
305哺乳類ヒナコウモリカグヤコウモリMyotis frater kaguyae希少種絶滅危惧II類--
306哺乳類ヒナコウモリフジホオヒゲコウモリMyotis ikonnikovi fujiensis希少種絶滅危惧II類準絶滅危惧-1991年版では種ヒメホオヒゲコウモリで評価した。
307哺乳類ヒナコウモリヒメホオヒゲコウモリMyotis ikonnikovi ikonnikovi希少種絶滅危惧IB類--
308哺乳類ヒナコウモリオゼホオヒゲコウモリMyotis ikonnikovi ozensis希少種情報不足情報不足-
309哺乳類ヒナコウモリエゾホオヒゲコウモリMyotis ikonnikovi yesoensis希少種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類-1991年版では種ヒメホオヒゲコウモリで評価した。
310哺乳類ヒナコウモリヒナコウモリVespertilio superans-絶滅危惧II類--
311哺乳類オヒキコウモリオヒキコウモリTadarida insignis希少種情報不足絶滅危惧IB類絶滅危惧II類
312哺乳類オヒキコウモリスミイロオヒキコウモリTadarida latouchei希少種情報不足情報不足情報不足1991年版では種オヒキコウモリで評価した。
313哺乳類オナガザル北奥羽・北上山系のホンドザルMacaca fuscata fuscata地域個体群地域個体群地域個体群地域個体群1991年版では東北地方のニホンザル個体群（下北半島の個体群を除く）で、1998年版では「東北地方のホンドザル」で評価した。
314哺乳類オナガザル金華山のホンドザルMacaca fuscata fuscata地域個体群地域個体群地域個体群地域個体群1991年版では東北地方のニホンザル個体群（下北半島の個体群を除く）で、1998年版では「東北地方のホンドザル」で評価した。
315哺乳類オナガザルヤクシマザルMacaca fuscata yakui希少種準絶滅危惧--
316哺乳類オナガザル下北半島のホンドザルMacaca fuscata fuscata(population in Shimokita Peninsula)地域個体群地域個体群--1991年版では「下北半島のニホンザル個体群（青森県）」で評価した。
317哺乳類リスエゾシマリスTamias sibiricus lineatus--情報不足情報不足
318哺乳類リス中国地方のニホンリスSciurus lis地域個体群地域個体群[2]地域個体群地域個体群1991年版では「琵琶湖以西のニホンリス個体群」で、中国地方以西（四国を除く）のニホンリスで評価した。
319哺乳類リス九州地方のニホンリスSciurus lis地域個体群地域個体群[2]地域個体群地域個体群1991年版では「琵琶湖以西のニホンリス個体群」で、中国地方以西（四国を除く）のニホンリスで評価した。
320哺乳類リスホンドモモンガPteromys momonga希少種---
321哺乳類ヤマネヤマネGlirulus japonicus希少種準絶滅危惧準絶滅危惧-
322哺乳類ネズミセスジネズミApodemus agrarius-絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
323哺乳類ネズミオキナワトゲネズミTokudaia muenninki危急種絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類1991年版では種アマミトゲネズミで評価した。
324哺乳類ネズミアマミトゲネズミTokudaia osimensis危急種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
325哺乳類ネズミトクノシマトゲネズミTokudaia tokunoshimensis危急種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類1998年版まではアマミトゲネズミに含めて評価した。
326哺乳類ネズミケナガネズミDiplothrix legata危急種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
327哺乳類ネズミミヤマムクゲネズミClethrionomys rex montanus希少種準絶滅危惧準絶滅危惧準絶滅危惧
328哺乳類ネズミリシリムクゲネズミClethrionomys rex rex希少種準絶滅危惧準絶滅危惧準絶滅危惧
329哺乳類ネズミワカヤマヤチネズミEothenomys imaizumii希少種---
330哺乳類ネズミミヤケアカネズミApodemus miyakensis希少種---
331哺乳類ネズミカラフトアカネズミApodemus peninsulae giliacus希少種---
332哺乳類ナキウサギエゾナキウサギOchotona hyperborea yesoensis-地域個体群地域個体群準絶滅危惧1998年版では「夕張・芦別のナキウサギ」で、2006年版までは「夕張・芦別のエゾナキウサギ」で評価されていた。
333哺乳類ウサギアマミノクロウサギPentalagus furnessi危急種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
334哺乳類ウサギサドノウサギLepus brachyurus lyoni--準絶滅危惧準絶滅危惧
335哺乳類クマ天塩・増毛地方のエゾヒグマUrsus arctos yesoensis--地域個体群地域個体群
336哺乳類クマ石狩西部のエゾヒグマUrsus arctos yesoensis地域個体群地域個体群地域個体群地域個体群
337哺乳類クマ下北半島のツキノワグマUrsus thibetanus japonicus-地域個体群地域個体群地域個体群
338哺乳類クマ紀伊半島のツキノワグマUrsus thibetanus japonicus地域個体群地域個体群地域個体群地域個体群
339哺乳類クマ東中国地域のツキノワグマUrsus thibetanus japonicus地域個体群地域個体群地域個体群地域個体群1991年版では「東中国山地（氷ノ山）のツキノワグマ個体群」で評価した。
340哺乳類クマ西中国地域のツキノワグマUrsus thibetanus japonicus地域個体群地域個体群地域個体群地域個体群1991年版では「西中国地域のツキノワグマ個体群（島根県、広島県、山口県）」で評価した。
341哺乳類クマ四国山地のツキノワグマUrsus thibetanus japonicus地域個体群地域個体群地域個体群地域個体群
342哺乳類クマ九州地方のツキノワグマUrsus thibetanus japonicus地域個体群地域個体群地域個体群-
343哺乳類イヌエゾオオカミCanis lupus hattai絶滅種絶滅絶滅絶滅
344哺乳類イヌニホンオオカミCanis lupus hodophilax絶滅種絶滅絶滅絶滅
345哺乳類イタチニホンカワウソ（本州以南亜種）Lutra lutra nippon絶滅危惧種絶滅危惧IA類[2]絶滅危惧IA類絶滅1991年版ではニホンカワウソ（Lutra nippon）で評価した。
346哺乳類イタチニホンカワウソ（北海道亜種）Lutra lutra whiteleyi絶滅危惧種絶滅危惧IA類[2]絶滅危惧IA類絶滅1991年版ではニホンカワウソ（Lutra nippon）で評価した。
347哺乳類イタチラッコEnhydra lutris希少種情報不足絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
348哺乳類イタチチョウセンイタチMustela sibirica coreana--準絶滅危惧準絶滅危惧自然分布域である対馬の個体群が対象である（国内移入である西日本地域は対象外）。
349哺乳類イタチニホンイイズナ（本州亜種）Mustela nivalis namiyei地域個体群準絶滅危惧地域個体群準絶滅危惧1991年版では「青森県の「ニホンイイズナ個体群」で、2006年版では「本州のニホンイイズナ」として評価されていた。
350哺乳類イタチホンドオコジョMustela erminea nippon希少種準絶滅危惧準絶滅危惧準絶滅危惧
351哺乳類イタチエゾオコジョMustela erminea orientalis希少種準絶滅危惧準絶滅危惧準絶滅危惧
352哺乳類イタチツシマテンMartes melampus tsuensis危急種絶滅危惧II類準絶滅危惧準絶滅危惧
353哺乳類イタチエゾクロテンMartes zibellina brachyura-情報不足準絶滅危惧準絶滅危惧
354哺乳類ネコイリオモテヤマネコPrionailurus bengalensis iriomotensis絶滅危惧種絶滅危惧IB類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
355哺乳類ネコツシマヤマネコPrionailurus bengalensis euptilura絶滅危惧種絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
356哺乳類アシカニホンアシカZalophus japonicus絶滅種絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
357哺乳類アシカトドEumetopias jubatus-絶滅危惧II類絶滅危惧II類準絶滅危惧
358哺乳類アザラシゼニガタアザラシPhoca vitulina危急種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧II類
359哺乳類イノシシ徳之島のリュウキュウイノシシSus scrofa riukiuanus地域個体群地域個体群地域個体群地域個体群
360哺乳類シカ馬毛島のニホンジカCervus nippon---地域個体群
361哺乳類シカケラマジカCervus nippon keramae危急種---
362哺乳類シカヤクシカCervus nippon yakushimae希少種---
363哺乳類シカツシマジカCervus pulchellus希少種---
364哺乳類ウシ九州地方のカモシカCapricornis crispus地域個体群-地域個体群地域個体群1991年版では「九州のニホンカモシカ個体群」で評価した。
365哺乳類ウシ四国のニホンカモシカ個体群Capricornis crispus crispus地域個体群---
366哺乳類ジュゴンジュゴンDugong dugon--絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
367汽水・淡水魚ヤツメウナギスナヤツメ北方種Lethenteron sp. 1-絶滅危惧II類絶滅危惧II類1999年版では「スナヤツメL. reissneri」で評価した。
368汽水・淡水魚ヤツメウナギスナヤツメ南方種Lethenteron sp. 2-絶滅危惧II類絶滅危惧II類1999年版では「スナヤツメLethenteron reissneri」で評価した。
369汽水・淡水魚ヤツメウナギカワヤツメLethenteron japonicum--絶滅危惧II類
370汽水・淡水魚ヤツメウナギシベリアヤツメLethenteron kessleri希少種準絶滅危惧準絶滅危惧
371汽水・淡水魚ヤツメウナギ栃木県のミツバヤツメEntosphenus tridentatus-情報不足地域個体群1999年版では「ミツバヤツメ」で評価した。
372汽水・淡水魚ヤツメウナギユウフツヤツメLampetra tridentata希少種--
373汽水・淡水魚チョウザメチョウザメAcipenser medirostris--絶滅
374汽水・淡水魚ウナギニホンウナギAnguilla japonica--情報不足絶滅危惧IB類[注 1]
375汽水・淡水魚ウナギニューギニアウナギAnguilla bicolor pacifica--情報不足情報不足
376汽水・淡水魚ウツボコゲウツボUropterygius concolor--絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
377汽水・淡水魚ウツボナミダカワウツボEchidna rhodochilus--絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
378汽水・淡水魚カタクチイワシエツCoilia nasus希少種絶滅危惧II類絶滅危惧II類1991年版では「エツ」と「佐賀県六角川のエツ個体群」に分けて評価した。
379汽水・淡水魚ニシンドロクイNematalosa japonica--絶滅危惧IB類
380汽水・淡水魚ニシン太平洋側湖沼系群のニシンClupea pallasii--地域個体群
381汽水・淡水魚ドジョウドジョウ科
382汽水・淡水魚ドジョウスジシマドジョウ小型種山陽型Cobitis sp., S San-yo form-絶滅危惧IB類絶滅危惧IA類1999年版では「スジシマドジョウ小型種」で評価した。
383汽水・淡水魚ドジョウアユモドキLeptobotia curta絶滅危惧種絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
384汽水・淡水魚ドジョウイシドジョウCobitis takatsuensis-絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
385汽水・淡水魚ドジョウヒナイシドジョウCobitis shikokuensis-絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類1999年版では「イシドジョウ」に含められていた（2006年11月に新種記載）。
386汽水・淡水魚ドジョウスジシマドジョウ大型種Cobitis sp. L-絶滅危惧II類絶滅危惧IB類
387汽水・淡水魚ドジョウスジシマドジョウ小型種東海型Cobitis sp., S Tokai form-絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類1999年版では「スジシマドジョウ小型種」で評価した。
388汽水・淡水魚ドジョウスジシマドジョウ小型種琵琶湖型（淀川個体群を含む）Cobitis sp., S Biwako form-絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類1999年版では「スジシマドジョウ小型種」で評価した。
389汽水・淡水魚ドジョウスジシマドジョウ小型種山陰型Cobitis sp., S San-in form-絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類1999年版では「スジシマドジョウ小型種」で評価した。
390汽水・淡水魚ドジョウスジシマドジョウ小型種九州型Cobitis sp., S Kyushu form-絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類1999年版では「スジシマドジョウ小型種」で評価した。
391汽水・淡水魚ドジョウエゾホトケドジョウLefua nikkonis-絶滅危惧II類絶滅危惧IB類
392汽水・淡水魚ドジョウホトケドジョウLefua echigonia-絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
393汽水・淡水魚ドジョウナガレホトケドジョウLefua sp.-絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
394汽水・淡水魚ドジョウアジメドジョウNiwaella delicata-地域個体群絶滅危惧II類1999年版では「大阪府のアジメドジョウ」で評価した。
395汽水・淡水魚ドジョウヤマトシマドジョウCobitis matsubarae--絶滅危惧II類
396汽水・淡水魚ドジョウスジシマドジョウ中型種Cobitis sp. M--絶滅危惧II類
397汽水・淡水魚コイスワモロコGnathopogon elongatus suwae-絶滅絶滅
398汽水・淡水魚コイミヤコタナゴTanakia tanago絶滅危惧種絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
399汽水・淡水魚コイイチモンジタナゴAcheilognathus cyanostigma-絶滅危惧IB類絶滅危惧IA類
400汽水・淡水魚コイイタセンパラAcheilognathus longipinnis絶滅危惧種絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
401汽水・淡水魚コイセボシタビラAcheilognathus tabira nakamurae-絶滅危惧II類絶滅危惧IA類
402汽水・淡水魚コイゼニタナゴAcheilognathus typus希少種絶滅危惧IB類絶滅危惧IA類
403汽水・淡水魚コイニッポンバラタナゴRhodeus ocellatus kurumeus絶滅危惧種絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
404汽水・淡水魚コイスイゲンゼニタナゴRhodeus atremius suigensis絶滅危惧種絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
405汽水・淡水魚コイヒナモロコAphyocypris chinensis絶滅危惧種絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
406汽水・淡水魚コイシナイモツゴPseudorasbora pumila pumila希少種絶滅危惧IB類絶滅危惧IA類
407汽水・淡水魚コイウシモツゴPseudorasbora pumilasubsp.絶滅危惧種絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
408汽水・淡水魚コイアブラヒガイSarcocheilichthys biwaensis-絶滅危惧IB類絶滅危惧IA類
409汽水・淡水魚コイホンモロコGnathopogon caerulescens--絶滅危惧IA類
410汽水・淡水魚コイゲンゴロウブナCarassius cuvieri--絶滅危惧IB類
411汽水・淡水魚コイニゴロブナCarassius auratus grandoculis--絶滅危惧IB類
412汽水・淡水魚コイタナゴAcheilognathus melanogaster-準絶滅危惧絶滅危惧IB類
413汽水・淡水魚コイシロヒレタビラAcheilognathus tabira tabira--絶滅危惧IB類
414汽水・淡水魚コイ山陰地方のアカヒレタビラAcheilognathus tabirasubsp.-地域個体群絶滅危惧IB類
415汽水・淡水魚コイカゼトゲタナゴRhodeus atremius atremius-絶滅危惧II類絶滅危惧IB類
416汽水・淡水魚コイワタカIschikauia steenackeri--絶滅危惧IB類
417汽水・淡水魚コイカワバタモロコHemigrammocypris rasborella地域個体群絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類1991年版では「静岡県のカワバタモロコ個体群」で評価した。
418汽水・淡水魚コイウケクチウグイTribolodon nakamurai危急種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
419汽水・淡水魚コイハスOpsariichthys uncirostris uncirostris--絶滅危惧II類
420汽水・淡水魚コイツチフキAbbottina rivularis--絶滅危惧II類
421汽水・淡水魚コイデメモロコSqualidus japonicus japonicus--絶滅危惧II類
422汽水・淡水魚コイキンブナCarassius auratussubsp. 2--準絶滅危惧
423汽水・淡水魚コイヤリタナゴTanakia lanceolata--準絶滅危惧
424汽水・淡水魚コイアブラボテTanakia limbata--準絶滅危惧
425汽水・淡水魚コイヤチウグイPhoxinus percnurus sachalinensis-準絶滅危惧準絶滅危惧
426汽水・淡水魚コイカワヒガイSarcocheilichthys variegatus--準絶滅危惧
427汽水・淡水魚コイスゴモロコSqualidus chankaensis biwae--準絶滅危惧
428汽水・淡水魚コイフナ属の1種（沖縄諸島産）Carassius sp.--情報不足
429汽水・淡水魚コイナガブナCarassius auratussubsp. 1--情報不足
430汽水・淡水魚コイヤマナカハヤPhoxinus lagowskii yamamotis-情報不足情報不足
431汽水・淡水魚コイ琵琶湖のコイ野生型Cyprinus carpio--地域個体群
432汽水・淡水魚コイ本州日本海側のマルタウグイTribolodon brandti--地域個体群
433汽水・淡水魚コイ東北地方のエゾウグイTribolodon sachalinensis--地域個体群
434汽水・淡水魚ナマズイワトコナマズSilurus lithophilus--準絶滅危惧
435汽水・淡水魚ナマズギギ科
436汽水・淡水魚ナマズネコギギPseudobagrus ichikawai絶滅危惧種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
437汽水・淡水魚ナマズギバチPseudobagrus tokiensis-絶滅危惧II類絶滅危惧II類
438汽水・淡水魚ナマズアリアケギバチPseudobagrus aurantiacus絶滅危惧種準絶滅危惧準絶滅危惧1991年版では「九州産ギバチ P. sp.」で評価した。
439汽水・淡水魚アカザアカザLiobagrus reini地域個体群絶滅危惧II類絶滅危惧II類1991年版では「九州のアカザ個体群」で評価した。
440汽水・淡水魚サケクニマスOncorhynchus nerka kawamurae絶滅種絶滅絶滅2010年、西湖にて生息を確認。
441汽水・淡水魚サケベニザケ（ヒメマス）Oncorhynchus nerka nerka--絶滅危惧IA類
442汽水・淡水魚サケイトウHucho perryi危急種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
443汽水・淡水魚サケオショロコマSalvelinus malma krascheninnikovi希少種準絶滅危惧絶滅危惧II類
444汽水・淡水魚サケミヤベイワナSalvelinus malma miyabei希少種準絶滅危惧絶滅危惧II類
445汽水・淡水魚サケゴギSalvelinus leucomaenis imbrius危急種地域個体群絶滅危惧II類1999年版では「西中国地方のイワナ（ゴギ）」で評価した。
446汽水・淡水魚サケサクラマス（ヤマメ）Oncorhynchus masou masou--準絶滅危惧
447汽水・淡水魚サケサツキマス（アマゴ）Oncorhynchus masou ishikawae絶滅危惧種-準絶滅危惧
448汽水・淡水魚サケビワマスOncorhynchus masousubsp.希少種準絶滅危惧準絶滅危惧
449汽水・淡水魚サケニッコウイワナSalvelinus leucomaenis pluvius--情報不足
450汽水・淡水魚サケ紀伊半島のヤマトイワナ（キリクチ）Salvelinus leucomaenis japonicus絶滅危惧種地域個体群地域個体群1991年版では「キリクチ」で評価した。
451汽水・淡水魚サケイワメOncorhynchus iwame絶滅危惧種--
452汽水・淡水魚アユリュウキュウアユPlecoglossus altivelis ryukyuensis絶滅危惧種絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
453汽水・淡水魚シラウオアリアケシラウオSalanx ariakensis絶滅危惧種絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
454汽水・淡水魚シラウオアリアケヒメシラウオNeosalanx reganius絶滅危惧種絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
455汽水・淡水魚シラウオキュウリウオ科
456汽水・淡水魚シラウオイシカリワカサギHypomesus olidus-情報不足準絶滅危惧
457汽水・淡水魚シラウオ襟裳岬以西のシシャモSpirinchus lanceolatus--地域個体群
458汽水・淡水魚タウナギタウナギMonopterus sp.地域個体群地域個体群絶滅危惧IB類1999年版までは、沖縄島のタウナギで評価。
459汽水・淡水魚ボラカワボラCestraeus plicatilis--絶滅危惧IA類
460汽水・淡水魚ボラナガレフウライボラCrenimugil heterocheilos-絶滅危惧II類絶滅危惧IB類
461汽水・淡水魚ボラアンピンボラChelon subviridis--情報不足
462汽水・淡水魚ボラオニボラEllochelon vaigiensis--情報不足
463汽水・淡水魚ボラカマヒレボラMoolgarda pedaraki--情報不足
464汽水・淡水魚ボラモンナシボラMoolgarda engeli--情報不足
465汽水・淡水魚メダカメダカ北日本集団Oryzias latipes subsp.地域個体群絶滅危惧II類絶滅危惧II類1991年版では「沖縄のメダカ個体群」で、1999年版では種「メダカ」で評価した。
466汽水・淡水魚メダカメダカ南日本集団Oryzias latipes latipes地域個体群絶滅危惧II類絶滅危惧II類1991年版では「沖縄のメダカ個体群」で、1999年版では種「メダカ」で評価した。
467汽水・淡水魚サヨリコモチサヨリZenarchopterus dunckeri--準絶滅危惧
468汽水・淡水魚サヨリクルメサヨリHyporhamphus intermedius--準絶滅危惧
469汽水・淡水魚トゲウオミナミトミヨPungitius kaibarae絶滅種絶滅絶滅
470汽水・淡水魚トゲウオハリヨGasterosteus aculeatus leiurus危急種地域個体群絶滅危惧IA類1999年版では「福島以南の陸封イトヨ類（ハリヨを含む）」で評価した。
471汽水・淡水魚トゲウオムサシトミヨPungitius sp. 1絶滅危惧種絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
472汽水・淡水魚トゲウオトミヨ属雄物型Pungitius sp. 2-絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類1999年版では「イバラトミヨ雄物型」で評価した。
473汽水・淡水魚トゲウオトミヨ属汽水型Pungitius sp. 3--準絶滅危惧
474汽水・淡水魚トゲウオエゾトミヨPungitius tymensis希少種準絶滅危惧準絶滅危惧
475汽水・淡水魚トゲウオ福島県以南の陸封イトヨ太平洋型Gasterosteus aculeatus aculeatus地域個体群地域個体群地域個体群1991年版では「福島県会津のイトヨ個体群（地域個体群）」および「福井県大野盆地のイトヨ個体群（地域個体群）」で、1999年版では「福島以南の陸封イトヨ類（ハリヨを含む）」で評価した。
476汽水・淡水魚トゲウオ本州のイトヨ日本海型Gasterosteus aculeatus aculeatus--地域個体群
477汽水・淡水魚トゲウオ本州のトミヨ属淡水型Pungitius pungitius--地域個体群
478汽水・淡水魚ヨウジウオホシイッセンヨウジMicrophis (Coelonotus) argulus--絶滅危惧IA類
479汽水・淡水魚ヨウジウオタニヨウジMicrophis (Lophocampus) retzii--絶滅危惧IA類
480汽水・淡水魚ヨウジウオヒメテングヨウジMicrophis (Oostethus) jagorii--絶滅危惧IA類
481汽水・淡水魚フグ沖縄島のクサフグakifugu niphobles--地域個体群
482汽水・淡水魚ハオコゼアゴヒゲオコゼTetraroge barbata--絶滅危惧IA類
483汽水・淡水魚ハオコゼヒゲソリオコゼTetraroge niger--絶滅危惧IA類
484汽水・淡水魚カジカヤマノカミTrachidermus fasciatus危急種絶滅危惧II類絶滅危惧IB類
485汽水・淡水魚カジカカジカ小卵型Cottus reinii-絶滅危惧II類絶滅危惧IB類1999年版では和名は「ウツセミカジカ」。
486汽水・淡水魚カジカカジカ中卵型Cottus sp.--絶滅危惧IB類
487汽水・淡水魚カジカカマキリ（アユカケ）Cottus kazika--絶滅危惧II類
488汽水・淡水魚カジカカジカ大卵型Cottus pollux--準絶滅危惧
489汽水・淡水魚カジカ東北・北陸地方のカンキョウカジカCottus hangiongensis--地域個体群
490汽水・淡水魚カジカ東北地方のハナカジカCottus nozawae-地域個体群地域個体群
491汽水・淡水魚アカメアカメLates japonicus希少種準絶滅危惧絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
492汽水・淡水魚イサキダイダイコショウダイPlectorhinchus albovittatus--情報不足情報不足
493汽水・淡水魚キスアオギスSillago parvisquamis--絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
494汽水・淡水魚キスアトクギスSillaginops macrolepis--絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
495汽水・淡水魚シマイサキヨコシマイサキMesopristes cancellatus-絶滅危惧IB類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
496汽水・淡水魚シマイサキニセシマイサキMesopristes argenteus-絶滅危惧IB類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
497汽水・淡水魚シマイサキシミズシマイサキMesopristes iravi-絶滅危惧IB類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
498汽水・淡水魚ペルキクティスオヤニラミCoreoperca kawamebari希少種準絶滅危惧絶滅危惧II類絶滅危惧II類
499汽水・淡水魚タイナンヨウチヌAcanthopagrus berda--準絶滅危惧絶滅危惧Ⅱ類
500汽水・淡水魚スズキ有明海のスズキLateolabrax japonicus--地域個体群地域個体群
501汽水・淡水魚ハゼ北海道南部・東北地方のスミウキゴリGymnogobius petschiliensis--地域個体群地域個体群
502汽水・淡水魚タカサゴイシモチナンヨウタカサゴイシモチAmbassis interrupta--絶滅危惧II類情報不足
503汽水・淡水魚テッポウウオテッポウウオToxotes jaculatrix--情報不足絶滅危惧IA類
504汽水・淡水魚テンジクダイカガミテンジクダイYarica hyalosoma--絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
505汽水・淡水魚テンジクダイハナダカタカサゴイシモチAmbassis macracanthus--情報不足情報不足
506汽水・淡水魚テンジクダイワキイシモチFibramia lateralis--情報不足情報不足
507汽水・淡水魚テンジクダイヒルギヌメリテンジクダイPseudamia amblyuroptera--情報不足情報不足
508汽水・淡水魚フエダイウラウチフエダイLutjanus goldiei-絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
509汽水・淡水魚ユゴイトゲナガユゴイKuhlia munda--絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
510汽水・淡水魚ヘビギンポウラウチヘビギンポEnneapterygius cheni--絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
511汽水・淡水魚イソギンポヒルギギンポOmox biporos--絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
512汽水・淡水魚イソギンポカワギンポOmobranchus ferox--絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
513汽水・淡水魚イソギンポゴマクモギンポOmobranchus elongatus--情報不足情報不足
514汽水・淡水魚ネズッポナリタイトヒキヌメリPseudocalliurichthys ikedai--情報不足情報不足
515汽水・淡水魚ツバサハゼツバサハゼRhyacichthys aspro希少種絶滅危惧IB類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
516汽水・淡水魚カワアナゴオウギハゼBunaka gyrinoides--情報不足準絶滅危惧
517汽水・淡水魚ハゼトカゲハゼScartelaos histophorus-絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
518汽水・淡水魚ハゼヨロイボウズハゼLentipes armatus-絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
519汽水・淡水魚ハゼカエルハゼSmilosicyopus leprurus-絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
520汽水・淡水魚ハゼアカボウズハゼSicyopus zosterophorus-絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
521汽水・淡水魚ハゼハヤセボウズハゼStiphodon imperiorientis-絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
522汽水・淡水魚ハゼコンテリボウズハゼStiphodon atropurpureus--絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
523汽水・淡水魚ハゼドウクツミミズハゼLuciogobius albus希少種絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
524汽水・淡水魚ハゼミスジハゼCallogobius sp.-絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
525汽水・淡水魚ハゼウラウチイソハゼEviota ocellifer--絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
526汽水・淡水魚ハゼシマサルハゼOxyurichthys sp. 2--絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
527汽水・淡水魚ハゼヒメトサカハゼCristatogobius aurimaculatus-絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
528汽水・淡水魚ハゼクロトサカハゼCristatogobius nonatoae-絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
529汽水・淡水魚ハゼイサザGymnogobius isaza-準絶滅危惧絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
530汽水・淡水魚ハゼキセルハゼGymnogobius cylindricus-絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IB類
531汽水・淡水魚ハゼアゴヒゲハゼGlossogobius bicirrhosus-絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
532汽水・淡水魚ハゼコンジキハゼGlossogobius aureus-絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
533汽水・淡水魚ハゼカワクモハゼBathygobius sp.--絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
534汽水・淡水魚ハゼホホグロハゼMugilogobius parvus--絶滅危惧IA類準絶滅危惧
535汽水・淡水魚ハゼオガサワラヨシノボリRhinogobius sp. BI-絶滅危惧IB類絶滅危惧IA類絶滅危惧IB類
536汽水・淡水魚ハゼコマチハゼParioglossus taeniatus-絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
537汽水・淡水魚ハゼヒメサツキハゼParioglossus interruptus--絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
538汽水・淡水魚ハゼヤエヤマノコギリハゼButis amboinensis-絶滅危惧II類絶滅危惧IB類絶滅危惧IA類
539汽水・淡水魚ハゼヒスイボウズハゼStiphodon alcedo---絶滅危惧IA類
540汽水・淡水魚ハゼジャノメハゼBostrychus sinensis-絶滅危惧II類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
541汽水・淡水魚ハゼタナゴモドキHypseleotris cyprinoides希少種絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
542汽水・淡水魚ハゼタメトモハゼGiuris sp. 1-絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
543汽水・淡水魚ハゼタビラクチApocryptodon punctatus-絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧II類
544汽水・淡水魚ハゼムツゴロウBoleophthalmus pectinirostris危急種絶滅危惧II類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
545汽水・淡水魚ハゼチワラスボTaenioides cirratus--絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
546汽水・淡水魚ハゼルリボウズハゼSicyopterus lagocephalus-絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧II類
547汽水・淡水魚ハゼトサカハゼCristatogobius lophius-絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
548汽水・淡水魚ハゼクボハゼGymnogobius scrobiculatus-絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
549汽水・淡水魚ハゼジュズカケハゼGymnogobius castaneus-地域個体群絶滅危惧IB類準絶滅危惧
550汽水・淡水魚ハゼコシノハゼGymnogobius nakamurae-地域個体群絶滅危惧IB類絶滅危惧IA類
551汽水・淡水魚ハゼホクリクジュズカケハゼGymnogobius sp. 2-地域個体群絶滅危惧IB類絶滅危惧IA類
552汽水・淡水魚ハゼムサシノジュズカケハゼGymnogobius sp. 1-地域個体群絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
553汽水・淡水魚ハゼシマエソハゼSchismatogobius ampluvinculus-絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
554汽水・淡水魚ハゼエソハゼSchismatogobius roxasi-絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
555汽水・淡水魚ハゼマングローブゴマハゼPandaka lidwilli--絶滅危惧IB類絶滅危惧II類
556汽水・淡水魚ハゼアオバラヨシノボリRhinogobius sp. BB-絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IA類
557汽水・淡水魚ハゼキバラヨシノボリRhinogobius sp. YB-絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
558汽水・淡水魚ハゼコビトハゼParioglossus rainfordi--絶滅危惧IB類絶滅危惧IB類
559汽水・淡水魚ハゼホシマダラハゼOphiocara porocephala--絶滅危惧II類絶滅危惧II類
560汽水・淡水魚ハゼアサガラハゼCaragobius urolepis--絶滅危惧II類絶滅危惧II類
561汽水・淡水魚ハゼワラスボOdontamblyopus lacepedii--絶滅危惧II類絶滅危惧II類
562汽水・淡水魚ハゼヒゲワラスボTrypauchenopsis intermedia--絶滅危惧II類絶滅危惧II類
563汽水・淡水魚ハゼシロウオLeucopsarion petersii-準絶滅危惧絶滅危惧II類絶滅危惧II類
564汽水・淡水魚ハゼミナミヒメミミズハゼLuciogobius sp.-地域個体群絶滅危惧II類絶滅危惧II類
565汽水・淡水魚ハゼエドハゼGymnogobius macrognathos-絶滅危惧IB類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
566汽水・淡水魚ハゼチクゼンハゼGymnogobius uchidai-絶滅危惧IB類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
567汽水・淡水魚ハゼシンジコハゼGymnogobius taranetzi希少種絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
568汽水・淡水魚ハゼハゼクチAcanthogobius hasta--絶滅危惧II類絶滅危惧II類
569汽水・淡水魚ハゼミナミアシシロハゼAcanthogobius insularis-絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
570汽水・淡水魚ハゼマサゴハゼPseudogobius masago-地域個体群絶滅危惧II類絶滅危惧II類
571汽水・淡水魚ハゼキララハゼAcentrogobius viridipunctatus-絶滅危惧II類絶滅危惧II類絶滅危惧II類
572汽水・淡水魚ハゼゴマハゼPandaka sp.--絶滅危惧II類絶滅危惧II類
573汽水・淡水魚ハゼボルネオハゼParioglossus palustris--絶滅危惧II類絶滅危惧II類
574汽水・淡水魚ハゼゴシキタメトモハゼGiuris sp. 2--準絶滅危惧絶滅危惧IB類
575汽水・淡水魚ハゼトビハゼPeriophthalmus modestus-地域個体群準絶滅危惧準絶滅危惧
576汽水・淡水魚ハゼイドミミズハゼLuciogobius pallidus希少種情報不足準絶滅危惧準絶滅危惧
577汽水・淡水魚ハゼヒモハゼEutaeniichthys gilli--準絶滅危惧準絶滅危惧
578汽水・淡水魚ハゼホクロハゼAcentrogobius caninus--準絶滅危惧準絶滅危惧
579汽水・淡水魚ハゼトウカイヨシノボリRhinogobius sp. TO--準絶滅危惧準絶滅危惧
580汽水・淡水魚ハゼショウキハゼTridentiger barbatus--準絶滅危惧準絶滅危惧
581汽水・淡水魚ハゼイシドンコOdontobutis hikimius--情報不足絶滅危惧II類
582汽水・淡水魚ハゼエリトゲハゼBelobranchus belobranchus--情報不足情報不足
583汽水・淡水魚ハゼカキイロヒメボウズハゼStiphodon surrufus--情報不足情報不足
584汽水・淡水魚ハゼネムリミミズハゼLuciogobius dormitoris-情報不足情報不足情報不足
585汽水・淡水魚ハゼドウケハゼStenogobius ophthalmoporus--情報不足情報不足
586汽水・淡水魚ハゼヘビハゼGymnogobius mororanus--情報不足情報不足
587汽水・淡水魚ハゼスダレウロハゼGlossogobius circumspectus--情報不足準絶滅危惧
588汽水・淡水魚ハゼフタゴハゼGlossogobius sp.--情報不足情報不足
589汽水・淡水魚ハゼコクチスナゴハゼPseudogobius gastrospilos--情報不足情報不足
590汽水・淡水魚ハゼニセシラヌイハゼSilhouettea sp.--情報不足準絶滅危惧
591汽水・淡水魚ハゼシラヌイハゼSilhouettea dotui--情報不足準絶滅危惧
592汽水・淡水魚ハゼタスキヒナハゼRedigobius balteatus-絶滅危惧IA類情報不足情報不足
593汽水・淡水魚ハゼフタホシハゼMugilogobius fuscus--情報不足情報不足
594汽水・淡水魚ハゼムジナハゼMugilogobius mertoni--情報不足絶滅危惧II類
595汽水・淡水魚ハゼニセツムギハゼAcentrogobius audax--情報不足準絶滅危惧
596汽水・淡水魚ハゼホホグロスジハゼAcentrogobius suluensis--情報不足準絶滅危惧
597汽水・淡水魚ハゼギンポハゼParkraemeria saltator--情報不足絶滅危惧II類
598汽水・淡水魚ハゼビワヨシノボリRhinogobius sp. BW--情報不足情報不足
599汽水・淡水魚ハゼナミノコハゼGobitrichinotus radiocularis--情報不足準絶滅危惧
600汽水・淡水魚ハゼトンガスナハゼKraemeria tongaensis--情報不足情報不足
601汽水・淡水魚ハゼマイコハゼParioglossus lineatus-絶滅危惧IA類情報不足情報不足
602汽水・淡水魚ハゼニライカナイボウズハゼStiphodon niraikanaiensis---情報不足
603汽水・淡水魚ハゼトラフボウズハゼStiphodon multisquamus---情報不足
604汽水・淡水魚ゴクラクギョタイワンキンギョMacropodus opercularis希少種絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類絶滅危惧IA類
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